해당 발언 이후 이 원장이 금융위원회를 월권한 것 아니냐는 지적이 나왔다. 이 원장이 금융위 정례회의 당연직 위원이지만, 공매도 전면재개 여부는 금융위 소관이어서다. 특히 김주현 금융위원장은 공매도와 관련해 "시기와 방법은 여러 가지 불확실성이 있으니 계속 검토 중"이라고 말해 온도차를 보이기도 했다.
다만 월권에 대해 이 원장은 "금감원이 적절한 의견을 안 내는 것 자체가 직무유기라고 생각한다"면서 "공매도를 둘러싼 여러 가지 이슈는 국정 운영에 매우 중요한 상황이며, 공매도로 인한 효과와 분석을 담당하고 있는 금감원에서는 적절한 의견을 드리지 않을 수 없다"고 강조했다.